Az Európai Közösséget létrehozó Szerződés (EKSz.) 81. és 82. cikkében foglalt versenyszabályok a közös piacra nézve tilalmazzák a versenyt korlátozó megállapodások megkötését, valamint az erőfölényes helyzettel való visszaélést, és tartalmilag megfelelnek a versenytörvény - a versenykorlátozó megállapodások és az erőfölénnyel való visszaélés tilalmára vonatkozó - rendelkezéseinek. A GVH jogsértés gyanúja esetén jogosult és egyben köteles a közösségi jogot alkalmazni (vagyis a közösségi versenyjog feltételezett megsértése miatt eljárást indítani), ha a magyar versenyjog rendelkezéseinek feltételezett megsértése miatt eljárást indítana, és a magatartás hatással lehet a tagállamok közötti kereskedelemre
Az eljárásban a GVH-nak anyagi jogi szabályként elsődlegesen az EKSz. versenyszabályait, az egyéb közösségi jogi aktusokat (rendeleteket és bizottsági közleményeket), továbbá az Európai Bizottság, valamint az Elsőfokú Bíróság és az Európai Bíróság esetjogi gyakorlatában kikristályosodott jogelveket kell - a magyar eljárásjog alapján - alkalmaznia, míg a versenytörvény anyagi jogi rendelkezései párhuzamosan alkalmazhatók. Az EKSz. versenyszabályainak alkalmazása során az Európai Versenyhálózat tagjai szorosan együttműködnek egymással a jogalkalmazás hatékonyságának és egységének biztosítása érdekében. Az együttműködés főbb szabályait a közösségi versenyszabályok alkalmazásának eljárási kereteit meghatározó 1/2003/EK tanácsi rendelet tartalmazza.
Az európai uniós csatlakozás a fúziókontroll területén is hozott változást. A közösségi léptékű összefonódások, vagyis a Tanács 139/2004/EK rendeletében meghatározott küszöbszámokat meghaladó forgalmú vállalkozások több tagállamot is érintő összefonódásai esetén az előzetes engedélyezés nem a nemzeti versenyhatóságok (így a GVH), hanem főszabályként az Európai Bizottság hatáskörébe tartozik.